Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PFDN4Q9NQP4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PFDN4Q9NQP4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PFDN4Q9NQP4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PFDN4Q9NQP4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PFDN4Q9NQP4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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PFDN4Q9NQP4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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