Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSU72Q9NP77 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms