Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP1Q9C000 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms