Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms