Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms