Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms