Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD2Q9BSE4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms