Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q71RC1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q71RC1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q71RC1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q71RC1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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