Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP4R4Q6NUP7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms