Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN52Q52LA3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms