Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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