Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAPVD1Q14C86 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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