Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME3Q13232 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME3Q13232 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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