Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGNL1Q0VF96 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms