Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3CBP42338 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms