Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM23P36406 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms