Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms