Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms