Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF30P17039 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF30P17039 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms