Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 LIAS-204ENST00000424936 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGBP11216 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGBP11216 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms