Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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PKHD1P08F94 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PKHD1P08F94 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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