Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB2P05107 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB2P05107 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGB2P05107 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms