Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GOLGA8SH3BPF8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms