Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
USP17L12C9JPN9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP17L12C9JPN9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms