Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC8Q9Y2L5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms