Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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