Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC180Q9P1Z9 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC180Q9P1Z9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.1 ms