Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ARFGAP3Q9NP61 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms