Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BPESC1Q9GZL8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms