Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT27Q9BW83 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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