Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NPAS2Q99743 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS2Q99743 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms