Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SORT1Q99523 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms