Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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C9orf85Q96MD7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf85Q96MD7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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