Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms