Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXNL1Q96CM4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms