Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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