Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC36A4Q6YBV0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms