Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPPQ16740 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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