Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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