Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EIF4EBP1Q13541 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms