Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLFQ13129 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RLFQ13129 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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