Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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