Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSME1Q06323 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms