Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIN1Q05586 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIN1Q05586 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms