Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ATP7AQ04656 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms