Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IRF8Q02556 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms