Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms