Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID4P47928 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID4P47928 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID4P47928 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms