Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXC13P31276 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms