Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD34P28906 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD34P28906 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD34P28906 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms